חשבונית מס מונפקת ע"י עוסק על פי קריטריונים שנקבעו על ידי רשות המסים עם ביצוע עסקה או מתן שירות.

עוסק פטור ממע"מ לא רשאי להנפיק חשבונית מס ולא רשאי לנכות מס תשומות.

סעיף 38 לחוק מע”מ קובע מהם התנאים בהם יוכל לנכות עוסק מס תשומות, זאת בנוסף לדרישה כי התשומות ישמשו בעסקו של העוסק ולצרכי עסקו וכן ישמשו בעסקה חייבת.

״38.  (א)  עוסק זכאי לנכות מהמס שהוא חייב בו את מס התשומות הכלול בחשבונית מס שהוצאה לו כדין או בהצהרת ייבוא או במסמך אחר שאישר לענין זה המנהל, ובלבד שהצהרת הייבוא או המסמך האחר נושאים את שמו של העוסק כבעל הטובין ושהניכוי ייעשה בתוך ששה חדשים מיום הוצאת החשבונית, ההצהרה או המסמך.״

סעיף 38 לחוק קובע כי על העוסק נטל הראיה להוכיח כי מולאו דרישות החוק ועליו לוודא כי החשבונית הוצאה כדין, קרי, החשבונית ניתנת עבור עסקה החייבת במס לאחר ביצועה של העסקה.

עוסק שמנכה מס תשומות בידיעה כי אין בידיו מסמך כאמור בסעיף 38 לעיל, עובר על הוראות סעיף 117(ב) לחוק מע”מ שלצידו עונש מאסר של 5 שנים ובנסיבות מחמירות 7 שנים.